hugeping> Потому что в разных нодах могут быть особенности. Например блеклист - учитывается или нет в счётчиках? Нода может не хранить все сообщения, а только часть (последние 10000).
Если верить документации с гитхаба idec-net, то всё это не должно уменьшать счётчик. Сообщение добавилось — инкрементировали. Сообщение удалилось — счётчик не трогаем.